Üretken Yapay Zeka, bilim insanlarının yıllardır gözlemlediği bir sınırı aştı. Stanford Üniversitesi ve Arc Enstitüsü'ndeki araştırmacılar, yapay zekayı kullanarak tam viral genomlar tasarladı ve bu tasarımlardan 16'sı tamamen işlevsel virüsler çıktı. Kısmen işlevsel değil. Simüle edilmiş değil. Biyolojik anlamda gerçekten canlı ve bakterileri enfekte edebilme yeteneğine sahip.
12 Eylül 2025'te bioRxiv'de yayınlanan ön baskı, üretken yapay zekânın ilk kez çalışır durumda viral genomları tamamen otomatik olarak ürettiğini işaret ediyor. Bunlar, insanları değil, bakterileri enfekte eden bakteriyofajlardır.
Araştırmacıların aslında inşa ettikleri
Brian Hie liderliğindeki ekip, Arc Enstitüsü, NVIDIA ve UC Berkeley'den iş birliği yapanlarla, Evo 1 ve Evo 2 adlı genom dil modellerini kullandı. Cümledeki bir sonraki kelimeyi tahmin etmek yerine, DNA dizisindeki bir sonraki baz çiftini tahmin ettiler.
Takım, E. coli'yi enfekte eden bir bakteriyofaj olan ΦX174 adlı doğal bir virüsün yapısına dayanarak 302 aday faj genomu oluşturdu. Bu 302 adaydan 16'sı deneysel olarak canlı virüsler oluşturacak şekilde birleşti ve E. coli bakterilerini başarıyla enfekte edip liz etti.
AI tarafından tasarlanan birkaç varyant, temel aldığı doğal şablon üzerinde en fazla 65 kat kadar çoğalma avantajı gösterdi. Takım, bu AI tarafından üretilen fajları dirençli bakteri türlerine karşı kombine tedavilerde test etti ve önemli bir etkinlik gösterdiler.
Antibiyotik direnci bunu neden önemli kılıyor
Antibiyotik direnci, küresel sağlık hizmetlerinde en az duyurulan krizlerden biridir. Belirli bakterileri öldürmek için virüsleri kullanan faj terapisi, 20. yüzyılın başlarından beri bir kavram olarak var olmasına rağmen, özellikle belirli bir bakteri türüne uygun faj tasarlamak zahmetli ve yavaş bir iş olduğu için ana akım klinik uygulamalarına ulaşamadı.
Evo modelleri, 2024'te tanıtılan önceki çalışmalarından türetilen trilyonlarca DNA baz çiftini içeren büyük miktarda genetik veri üzerinde kurulmuştur. Doğal ΦX174 fajının genomi yaklaşık 5.386 baz çiftinden oluşur, bu biyolojik standartlarla oldukça küçüktür.
Biyogüvenlik soruları zaten bu araştırmayı takip etmektedir
16 fonksiyonel faj, E. coli bakterilerini hedef alır ve bilinen bir doğal şablona göre tasarlanmıştır. Araştırmacılar, yeni bir pandemi patojeni üretmemişlerdir. Ancak temel yetenek, çalışır durumda bir virüs makinesi nasıl oluşturulacağını anlayan bir modeldir ve bu tür bir araç, teknoloji daha da ilerlemeden önce dikkatli bir yönetim konuşması gerektirir.
Bu işbirliğinde NVIDIA'nın katılımı, yapay zeka altyapısına yapılan yatırımların nereye doğru aktığına dikkat edenler için önemlidir. Bu ölçekte genomik modelleme önemli hesaplama gücü gerektirir ve yaşam bilimleri sektörü, yüksek performanslı GPU kümeleri için en önemli uygulama alanlarından biri haline gelmiştir.